广东医科大学的前身是中山医学院湛江分院，创建于1958年，1964年升格为五年制医学本科院校并更名为湛江医学院，1992年易名为广东医学院，2016年更名为广东医科大学。1960年被评为全国文教战线先进单位，1978年有2项科研成果获全国科学大会奖励，1986年获批为硕士学位授权单位，列为广东省属重点建设大学，1991年获广东省办学水平评估一等奖，2005年在教育部本科教学工作水平评估中获“优秀”，2008年设立博士后科研工作站，2012年获批设立教育部科技查新工作站，2013年获批为博士学位授予单位。2015年5月学校进入ESI全球排名前1%。2019年通过教育部临床医学专业认证，有效期6年。2021年8月进入广东省高水平大学建设计划重点学科建设高校行列。2022年9月广东医科大学附属医院获批国家省级区域医疗中心建设单位。2023年1月第一临床医学院入选广东省首批高水平临床医学院重点建设学院，公共卫生学院入选广东省首批高水平公共卫生学院培育建设学院。学校还进入高等教育研究机构世界大学排名中心（简称CWUR）和USNews世界大学排行榜榜单。